Eubacterium (эубактерии, род бактерий)
Эубактерии (лат. Eubacterium) — род грамположительных строго анаэробных бактерий, типичной нормальной микрофлоры кишечника человека, составляющие значительную часть от всех населяющих желудочно-кишечный тракт микроорганизмов. Не образуют спор. Форма чаще всего палочковидная. Отличаются жёсткой клеточной стенкой.
Некоторые виды эубактерий могут преобразовывать холестерин в копростанол, участвовать в деконъюгации желчных кислот. Многие эубактерии метаболизируют углеводы и пептоны с накоплением масляной, уксусной, муравьиной и других органических кислот, используемых энтероцитами в обменных процессах. Большинство видов эубактерий (28 из 30) являются сахаролитическими, то есть способными ферментировать углеводы с накоплением смеси короткоцепочечных жирных кислот. Отдельные штаммы сахаролитических эубактерий также могут синтезировать витамины, в частности кобаламин, аминокислоты (аланин, валин, изолейцин), расщеплять целлюлозу, участвовать в обмене стероидных гормонов.
В фекалиях больных полипозом толстой кишки обнаруживается повышенное содержание Eubacterium spp. (Moore W.E., Moore L.H. Intestinal floras of populations that have a high risk of colon cancer. Appl. Environ. Microbiol. 1995; 61: 3202-3207).
Термин эубактерии (лат. Eubacterium) также употребляется как синоним термина «бактерии», обозначает домен (надцарство) прокариотных (безъядерных) микроорганизмов, чаще всего одноклеточных и подчеркивает отличие «истинных бактерий» от «архебактерий» (археев). В связи с отсутствием среди ученых единого взгляда на систематику живых организмов, термином эубактерии иногда называются другие подобные крупнейшие группы микроорганизмов.
Эубактерии — нормальная микрофлора человека
Эубактерии относятся к основной резидентной микрофлоре как тонкой, так и толстой кишки человека. Эубактерии редко встречаются у детей, находящихся на грудном вскармливании, в то же время могут выявляться у детей, находящихся на искусственном вскармливании в количестве, соответствующем норме взрослого человека. В кале здоровых людей обнаруживается следующее количество эубактерий:
- у детей первого года — 10 6 -10 7 КОЕ/г
- у детей старше года и взрослых, включая пожилых — 10 9 -10 10 КОЕ/г
Как показано на рисунке выше, эубактерии видов Eubacterium rectale и Eubacterium hallii присутствуют в заметном количестве среди других доминантных видов толстой кишки человека (данное исследование относится к английской популяции, но и в других популяциях наблюдается аналогичная картина).
Эубактерии входят в состав микрофлоры влагалища у четверти всех здоровых женщин.
Эубактерии Eubacterium ramulus, [Eubacterium] hallii (наряду с Roseburia faecis, [Eubacterium] rectale, Roseburia cecicola, Faecalibacterium prausnitzii и Coprococcus) являются основными продуцентами масляной кислоты (бутиратов) в толстой кишке. Бутираты играют важную роль в физиологии, они является основным энергетическим материалом для колоноцитов, поддерживают кишечный гомеостаз, предотвращает развития различных заболеваний кишечника.
На сайте GastroScan.ru в разделе «Литература» имеется подраздел «Микрофлора, микробиоценоз, дисбиоз (дисбактериоз)», содержащий статьи, затрагивающие проблемы микробиоценоза и дисбиоза отделов ЖКТ человека.
Эубактерии — причина заболеваний человека
Антибиотики, активные в отношении эубактерий
Эубактерии в систематике бактерий
По современной систематике* род эубактерии входит в семейство Eubacteriaceae, порядок Clostridiales, класс Clostridia, тип Firmicutes, Terrabacteria group, царство Бактерии. Раньше род эубактерии относили к семейству Propionibacteriaceae.
В состав рода Eubacterium входят следующие виды эубактерий:
- [Eubacterium] budayi
- [Eubacterium] cellulosolvens
- [Eubacterium] combesii
- [Eubacterium] eligens
- [Eubacterium] hallii
- Eubacterium aggregans
- Eubacterium albensis
- Eubacterium barkeri
- Eubacterium brachy
- Eubacterium callanderi
- Eubacterium coprostanoligenes
- Eubacterium desmolans
- Eubacterium limosum
- Eubacterium multiforme
- Eubacterium nitritogenes
- Eubacterium oxidoreducens
- Eubacterium pectinii
- Eubacterium plexicaudatum
- Eubacterium pyruvativorans
- Eubacterium ramulus
- Eubacterium rangiferina
- Eubacterium ruminantium
- Eubacterium thermomarinus
- Eubacterium uniforme
- Eubacterium ventriosum
- Eubacterium xylanophilum
Входящий ранее в состав рода эубактерии вид Eubacterium rectale в настоящее время перенесён в семейство Lachnospiraceae этого же порядка Clostridiales. Так как вопрос с родом, к которому в рамках данного семейства должен относится этот вид, окончательно не решён, вид пока обозначается, как [Eubacterium] rectale.
Бывшие представители рода эубактерий: Eubacterium aerofaciens, Eubacterium lentum и Eubacterium timidum в настоящее время переклассифицированы как: Collinsella aerofaciens, Eggerthella lenta и Mogibacterium timidum, соответственно.
Вид Eubacterium formicigenerans перенесён в род Dorea и переименован в Dorea formicigenerans.
Виды Eubacterium moniliforme и Eubacterium tarantellae перенесены в род Clostridium и названы Clostridium moniliforme и Clostridium tarantellae.
Вид Eubacterium saphenum перенесён в семейство Clostridiales Family XIII. Incertae Sedis и именуется [Eubacterium] saphenum.
Вид Eubacterium acidaminophilum перенесён в род Peptoclostridium семейства Peptostreptococcaceae и в настоящее время именуется Peptoclostridium acidaminophilum.
Вид Eubacterium tenue перенесён в род Paeniclostridium семейства Peptostreptococcaceae и именуется [Eubacterium] tenue.
Вид Eubacterium yurii перенесён в род Peptoanaerobacter семейства Peptostreptococcaceae и именуется [Eubacterium] yurii.
Вид Eubacterium hadrum перенесён в род Anaerostipes и назван Anaerostipes hadrus.
* Исходя из соображений определённости и удобства пользования мы ориентируемся на систематику Национального центра биотехнологической информации США (National Center for Biotechnology Information), не утверждая, что она чем-то лучше или хуже других.
Источник
Eubacterium spp что это значит у женщин
Фемофлор 16 – расширенное молекулярно-биологическое исследование качественного и количественного состава микрофлоры мочеполовых путей у женщин, включающее оценку общей бактериальной массы, состояния нормофлоры, определение широкого спектра клинически значимых условно-патогенных микроорганизмов, в том числе микоплазм и уреаплазм, а также грибов рода Candida.
Исследование информативно только для женщин репродуктивного возраста.
Исследование биоценоза влагалища методом ПЦР.
Femoflor 16 Real Time PCR.
Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Как правильно подготовиться к исследованию?
- Исследование (процедуру взятия урогенитального мазка) рекомендуется производить до менструации или через 2-3 дня после её окончания.
Общая информация об исследовании
По данным проекта Human Microbiom Project Национального института здоровья США, установлено, что в организме человека обитает около 10 000 видов микроорганизмов, преимущественными локусами распространения которых являются кожа, кишечник и урогенитальный тракт. Микрофлора мочеполовых путей у женщин в норме представлена преимущественно различными видами бактерий рода Lactobacillus, которые играют большую роль в предотвращении колонизации урогенитального тракта болезнетворными микроорганизмами. Вследствие различных причин может возникать дисбаланс микробиоты мочеполового тракта, выражающийся в нарушении её количественных и качественных характеристик, что в итоге приводит к развитию воспалительного процесса. Рядом исследований показано, что в этиологической структуре мочеполовых инфекций, обусловленных дисбалансом условно-патогенной флоры, в большинстве случаев играет роль ассоциация микроорганизмов и изменения в составе нормофлоры. Клинически такие состояния очень часто характеризуются нечеткой выраженностью симптомов, отсутствием специфических признаков и склонностью к хроническому течению, что обуславливает высокий риск присоединения инфекций, вызванных патогенными микроорганизмами, а также развития осложнений со стороны репродуктивной системы. Это определяет первостепенную роль своевременной и качественной диагностики урогенитальных инфекций, ассоциированных с условно-патогенной микрофлорой. Традиционные лабораторные исследования, проводимые для обнаружения болезнетворных микроорганизмов, которые позволяют определить факт наличия возбудителя, малоинформативны в диагностике заболеваний, вызванных условно-патогенной флорой, так как обнаружение её представителей само по себе не свидетельствует о заболевании. Также необходимо отметить, что условно-патогенная микрофлора, наиболее часто являющаяся причиной воспалительных заболеваний мочеполовых путей у женщин, представлена преимущественно анаэробными микроорганизмами (живущими в условиях отсутствия кислорода). Культивирование таких бактерий является технически очень сложным процессом, требующим специального оборудования, и в настоящее время в большинстве лечебных учреждений затруднено.
Проблему качественной диагностики урогенитальных инфекций, вызванных условно-патогенной флорой, позволило решить внедрение в практику метода полимеразной цепной реакции с детекцией результатов в режиме реального времени. Методика исследования основана на обнаружении в исследуемом материале генетического материала (ДНК) микроорганизма, его многочисленном копировании и идентификации. Так как количество полученных в конце реакции копий зависит от исходного количества исследуемой ДНК, анализ позволяет определить содержание микроорганизма в биоматериале. Отечественная разработка Фемофлор, основанная на технологии RT-ПЦР, предназначена для исследования биоценоза урогенитального тракта у женщин и позволяет выявлять ДНК условно-патогенных микроорганизмов, ДНК лактобактерий и геномной ДНК человека (в качестве контрольного параметра). Спектр выявляемых показателей позволяет получить комплексное представление о качественных и количественных изменениях состава микрофлоры урогенитального тракта, что во многом определяет адекватную тактику медикаментозной терапии. Разработано несколько вариантов комплектации тестовых систем Фемофлор, в зависимости от спектра выявляемых условно-патогенных микроорганизмов. Фемофлор 16 позволяет определять 25 показателей, включая контроль взятия материала, общую бактериальную массу и 23 группы микроорганизмов:
Lactobacillus spp. – в большинстве случаев составляют основу нормальной микрофлоры влагалища у женщин репродуктивного возраста;
Семейство Enterobacteriaceae, Streptococcus spp., Staphylococcus spp. – являются компонентами нормальной флоры урогенитального тракта у женщин, могут быть причиной вагинита;
Gardnerella vaginalis, Prevotella bivia, Porphyromonas spp. – представители нормальной и транзиторной (Gardnerella vaginalis) флоры, этиологические агенты развития бактериального вагиноза;
Eubacterium spp. – бактерии этого семейства преимущественно обитают в кишечнике, условно патогенны, могут вызывать развитие бактериального вагиноза;
Sneathia spp., Leptotrihia spp., Fusobacterium spp. – анаэробные микроорганизмы, с ними может быть ассоциировано развитие бактериального вагиноза;
Veilonella spp., Megasphaera spp., Dialister spp. – условно-патогенные анаэробные бактерии, участвуют в развитии бактериального вагиноза;
Lachnobacterium spp. – анаэробные труднокультивируемые бактерии, ассоциированы с развитием бактериального вагиноза;
Clostridium spp. – представитель нормальной флоры кишечника, в урогенитальном тракте условно-патогенный микроорганизм, может вызывать бактериальный вагиноз;
Mobiluncus spp., Corynebacterium spp. – анаэробные условно-патогенные микроорганизмы, могут вызывать инфекции урогенитального тракта;
Peptostreptococcus spp. – анаэробные кокки (шаровидные бактерии), условно-патогенны, могут вызывать бактериальный вагиноз;
Atopobium vaginae – анаэробный микроорганизм, может приводить к бактериальному вагинозу;
Mycoplasma hominis, Ureaplasma (urealyticum + parvum) – условные патогены;
Candida spp. – аэробные грибы, условно-патогенные микроорганизмы;
Mycoplasma genitalium – патогенный микроорганизм, вызывает уретрит (воспаление мочеиспускательного канала).
Для чего используется исследование?
- Для оценки качественного и количественного состава микрофлоры урогенитального тракта при наличии клинических проявлений воспаления, плановой подготовке к гинекологическим операциям, обследовании перед планированием беременности, в том числе при использовании вспомогательных репродуктивных технологий.
Когда назначается исследование?
При наличии клинических или лабораторных признаков воспалительного процесса урогенитального тракта.
При планирующихся оперативных вмешательствах на органах малого таза с высоким риском развития инфекционных осложнений.
Диагностический поиск при наличии отягощенного акушерского анамнеза (невынашивание беременности, перинатальные потери, бесплодие).
Плановое обследование перед планированием беременности, при подготовке к процедуре экстракорпорального оплодотворения.
Мониторинг эффективности проводимой терапии, восстановления нормоценоза.
Что означают результаты?
КВМ – контроль взятия материала. Необходимым условием качественного ПЦР-исследования считается правильное взятие биоматериала. Показателем адекватности полученного образца является достаточное количество ДНК человека, которая в процессе реакции выделяется из клеток, выстилающих слизистую оболочку и попадающих в пробу при правильном взятии мазка. Показатель КВМ менее 10 4 свидетельствует о недостоверных результатах ПЦР, в таких случаях рекомендуется повторное взятие биоматериала.
ОБМ (общая бактериальная масса) – общее количество бактерий, имеющихся в исследуемом образце. Снижение ОБМ ниже пороговых значений свидетельствует о недостаточном заселении данного локуса бактериями, в том числе вследствие антибиотикотерапии или гормональных нарушений.
Нормальная флора — Lactobacillus spp. — их абсолютное количество в норме практически не отличается от показателя общей бактериальной массы, так как лактобактерии являются ее главной составляющей. Относительный показатель лактобактерий высчитывается автоматически путем вычисления разницы десятичных логарифмов между абсолютным значением лактобактерий и ОБМ (например, для абсолютного показателя ОБМ 10 7 десятичный логарифм будет равен 7). Снижение относительного показателя лактобактерий отражает дисбаланс урогенитальной микрофлоры.
Оценка условно-патогенной флоры. Количество аэробных и анаэробных бактерий также оценивается в абсолютных и относительных показателях. Относительный показатель высчитывается по разнице между десятичными логарифмами микроорганизма или их группы и ОБМ. По уровню относительной величины определяется незначительное, умеренное и значительное повышение.
Оценка микоплазм, уреаплазм и грибов рода Candida проводится только по абсолютному показателю, при превышении определенного порога (10 3 для Candida, 10 4 для микоуреаплазм) аппарат фиксирует положительный результат.
Для более удобной интерпретации результатов исследования используется специальная цветовая маркировка:
контрольные показатели: белый – соответствие критериям, красный – несоответствие;
условно-патогенные микроорганизмы и дрожжеподобные грибы: белый – соответствие критериям нормы, желтый – умеренное отклонение, красный – выраженное отклонение от нормы;
нормальная флора (лактобациллы): зеленый – нормоценоз (соответствие критериям нормы), желтый – умеренный дисбиоз (умеренное отклонение от нормы), красный – выраженный дисбиоз;
патогенные микроорганизмы: белый – не обнаружены, красный – обнаружены.
По результатам исследования автоматически дается характеристика состояния микрофлоры: нормоценоз, умеренный или выраженный дисбаланс, который по этиологической структуре может быть анаэробным, аэробным и смешанным.
- Фемофлор 16 позволяет детально оценить состав микрофлоры, однако его желательно выполнять после исключения инфекций, вызванных патогенными микроорганизмами (Chlamydia trachomatis, Neisseria gohorrhoeae, Trichomonas vaginalis). Для уменьшения времени обследования возможно одновременное взятие биоматериала для обоих исследований.
Микроскопическое исследование отделяемого мочеполовых органов женщин (микрофлора), 3 локализации
Исследование микробиоценоза влагалища с определением чувствительности к антибиотикам
Chlamydia trachomatis, ДНК [реал-тайм ПЦР]
Neisseria gonorrhoeae, ДНК [реал-тайм ПЦР]
Trichomonas vaginalis, ДНК [реал-тайм ПЦР]
Планирование беременности — здоровье партнеров (для женщин)
Планирование беременности — здоровье партнеров (для мужчин)
Кто назначает исследование?
Гинеколог, репродуктолог, врач общей практики.
- Е. В. Рыбина. Современные методы оценки микробиоценоза влагалища. Журнал акушерства и женских болезней, том LXIV, выпуск 1/2015. С. 53-66.
- Ю. С. Шишкова, Т. В. Становая, Л. Н. Бугрова, Е. Д. Графова, Т. А. Пономарева. Молекулярно-биологический анализ содержания лактобактерий во влагалище у женщин репродуктивного возраста. Вестник Челябинского государственного университета. 2013, №7 (298). С. 44-45.
- Инструкция по применению набора реагентов для исследования биоценоза урогенитального тракта у женщин методом ПЦР в режиме реального времени Фемофлор. ООО «ДНК-Технология», 2017.
- Е. Е. Баранова, Е. И. Батенева, И. С. Галкина, А. Е. Донников, В. В. Зорина, Л. В. Тумбинская, Г. Г. Шигорина. ПЦР в реальном времени: новые возможности технологии в решении репродуктивных проблем. Пособие для врачей. ООО «ДНК-Технология».
Источник
