Что значит делеция экзона 7 не зарегистрирована это

Молекулярно-генетический анализ делеций 7-го/ или 8-го экзонов генов SMN1 и SMN2

Анализ делеций 7-го/ или 8-го экзонов генов SMN1 и SMN2

Молекулярно-генетическое исследование крови, которое выполнено методом полимеразной цепной реакции с последующей рестрикцией и позволяет обнаружить делеции 7-го либо 8-го экзонов генов SMN-1 и SMN-2, проводится для установления причин спинальной амиотрофии, прогнозирования ее течения и оценивания степени тяжести патологического процесса.

Спинальная амиотрофия является наследственной патологией, возникающей вследствие дегенеративных изменений в двигательных нейронах стволов головного и спинного мозга, обеспечивающих поддержание мышечного тонуса и моторную координацию. Впервые данное заболевание было описано еще в конце 19-го столетия. Благодаря исследованиям современных генетиков было установлено, что дегенерация мото-нейронов ассоциирована с полиморфизмом гена, способствующего их росту – SMN. Он кодирует синтез и функциональную деятельность белка, регулирующего процессы метаболизма нервных клеток и обеспечивающего доставку ядерных рибонуклео-протеинов по аксонам. Особенность данного гена состоит в том, его представляют 2 копии: SMN-1 локализуется в тело-мерной области 5-ой хромосомы, SMN-2 – в ее центромерной области.

Важными фрагментами гена SMN считаются 7-ой и 8-ой экзоны, в которых «зашифрована» информация о белке, входящем в структуру мото-нейронов. Нарушения этих участков приводят к изменению состава белка и провоцируют развитие спинальной амиоатрофии.

Когда делают анализ мутации гена SMN-1/2?

Молекулярно-генетический анализ на мутации гена SMN-1/2 проводят при:

• наличии у пациента клинических признаков спинальной мышечной атрофии, оценивании степени тяжести ее течения и прогнозирования исхода;
• планировании беременности – для определения вероятности носительства генетической мутации и риска рождения младенца с данной патологией;
• диагностировании и клиническом разграничении мышечной слабости и болезни мото-нейронов.

Как подготовиться к анализу?

Биологический материал для исследования – образец венозной крови, взятый в пробирку с ЭДТА.

Выполнения пациентом сложных подготовительных мероприятий к венепункции не требуется, накануне процедуры необходимо:

• ограничить физическую активность и курение;
• исключить распитие алкоголя;
• отменить прием фармакологических средств;
• избегать стрессовых ситуаций.

Расшифровка анализа крови

Итоговые данные исследования выдаются в следующих значениях:

1. Мутантные варианты обоих фрагментов гена SMN не обнаружены – отрицательный результат, который указывает на отсутствие риска возникновения спинальной амиотрофии как у самого пациента, так и у его ребенка.
2. Выявлены делеции (потери участков) 2-х аллелей гена – положительный результат.

При наличии полиморфизма в обеих участках гена развивается спинальная мышечная атрофия. Нарушение одной аллели является свидетельством носительства патологического гена, заболевание не развивается, однако существует вероятность рождения больного ребенка.

Источник

Расшифровка анализа на мутации в генах CFTR, PAH, SMN1, GJB2

Несмотря на то, что анализ на распространённые генные изменения проводится комплексно, показатели оцениваются отдельно. Взаимосвязи между дефектами генов не существует, тем не менее положительный результат хотя бы по одному из них – повод для прогнозирования плохой наследственности для ребёнка или бесплодия.

Дефект CFTR-гена – наиболее частая причина мужского бесплодия, вызванного врождённым муковисцидозом. Анализ проводится по 25 видам наиболее распространённых мутаций.

Таблица ниже показывает варианты соединения генов.

Результат	Пояснение
N / N	Отрицательно
N / M	Скрытое носительство
M / M	Муковисцидоз

Мужское бесплодие диагностируется не только при муковисцидозе, но и при скрытом носительстве. Если у обоих родителей обнаружен изменённый CFTR-ген, то ребёнок унаследует его с вероятностью 100%. Соединение мужских и женских клеток происходит по рецессивному типу, поэтому при наличии у одного из родителей более лёгкой формы, наследуется именно она.

Во время исследования оцениваются качественные показатели крови. Причём понятия «нормальный» и «патология» не применяются, поскольку исследуется полиморфизм гена – замена одного нуклеотида или изменение числа повторяющихся элементов ДНК.

Если количество аллелей (разновидностей гена) от 1% и более, результат положительный. Это означает, означает, что человек болеет определённой формой фенилкетонурии. Лабораторным путём определяется вероятность наследования заболевания. Соединение хромосом происходит по рецессивному типу, при этом прогнозировать развитие патологии у малыша можно только в том случае, если дефектный ген обнаружен у обоих родителей.

Патологией является дефект или отсутствие 7 экзона (фрагмента) в гене SMN1. Именно он отвечает за правильное формирование белка, необходимого для работы двигательных нейронов.

7 экзон	Диагноз
Делеция в одной копии	Носительство, симптомами не проявляется
Делеция в обоих копиях	Спинальная мышечная атрофия
Отсутствие дефектов	Отрицательно

Прогноз при планировании беременности

Если мутация обнаружена у обоих родителей, риск СМА у ребёнка – 25%. При этом в зависимости от тяжести симптомов и времени проявления различают 4 формы спинальной амиотрофии: младенческую, промежуточную, ювенильную, взрослую.

Расшифровка результатов анализа на мутации GJB2-гена выполняется по стандартной схеме:

Результат	Пояснение
N / N	Отрицательно
N / M	Скрытое носительство
M / M	Тугоухость

При соединении двух изменённых копий гена вероятность развития заболевания у ребёнка – 25%. Помимо нейросенсорной тугоухости наличие дефектов в генной структуре GJB2 позволяет прогнозировать и другие тяжёлые патологии: синдром Фовинкеля, Барта–Памфри, KID, кератодермию ладоней и стоп. Все они связаны с нарушением процесса ороговения в эпидермисе и всегда сочетаются с глухотой.

Перечисленные генные мутации относятся к аутосомно-рецессивным заболеваниям. Это значит, что «плохая» наследственность проявляется только при сочетании двух дефектных копий – от матери и от отца. Если патология обнаружена только у одного из родителей, риска для здоровья ребёнка нет.

Чтобы получить точную расшифровку анализа и рекомендации врача, обратитесь к специалистам Медицинского женского центра.

Источник

Что значит делеция экзона 7 не зарегистрирована это

Одним из наиболее частых аутосомно-рецессивных заболеваний является спинальная мышечная атрофия (СМА).
Спинальная мышечная атрофия – наследственное нервно-мышечное заболевание, причиной которого является постепенное и необратимое нарушение функций двигательных нейронов спинного мозга, приводящее к симметричному ослабеванию, а затем атрофии мышц. Хотя это заболевание относится к редким (орфанным), оно является вторым (после муковисцидоза) по распространенности из наследственных среди коренных европейцев и населения Северной Америки европейского происхождения.

Различают четыре типа СМА, в зависимости от возраста манифестации и степени проявления симптомов:

СМА 1 типа (младенческая форма), или болезнь Верднига-Гоффмана – самая ранняя и тяжелая форма заболевания. Обычный возраст начала 0-6 месяцев. Чаще всего дети с такой формой заболевания не доживают до 2-х лет.
СМА 2 типа (промежуточная форма), или болезнь Дубовица – возраст проявления этой формы заболевания 6-18 месяцев. Дети с таким типом СМА могут сидеть без поддержки, но не могут вставать и ходить. Тяжесть заболевания и прогноз зависит от скорости вовлечения в болезнь мышц, отвечающих за дыхание.
СМА 3 типа (ювенильная форма), болезнь Кюгельберга-Веландер – проявляется в возрасте старше 18 месяцев. Дети с этой формой СМА способны сравнительно длительное время ходить самостоятельно, слабость и атрофия мышц прогрессируют медленно.
СМА 4 типа (взрослая форма) — самая легкая форма заболевания, обычно проявляющаяся на втором или третьем десятилетии жизни симптомами, аналогичными ювенильной форме. Как правило, не приводит к снижению продолжительности жизни пациента.

Генетической причиной СМА являются мутации в гене SMN1. Ген SMN1 кодирует белок, необходимый для работы двигательных нейронов. Важной частью этого белка является фрагмент, информация о котором содержится в 7 экзоне (определенной части) гена SMN1. Любая мутация, которая приводит к отсутствию этого фрагмента в белке или же значительно нарушает строение белка, может привести к развитию заболевания. Полное отсутствие 7 экзона (делеция) является самой частой причиной СМА. Если на обеих хромосомах в гене SMN1 есть нарушения в 7 экзоне, то нормальный белок не будет формироваться, а отсутствие нормально функционирующего белка вызывает СМА.

В геноме человека также есть ген SMN2 . Он очень похож на ген SMN1 (99% совпадения последовательностей). Одно из ключевых отличий этих двух генов – определенный нуклеотид в 7 экзоне. Одна замена в последовательности гена SMN2 приводит к тому, что с него синтезируется нефункциональный белок. Однако, в результате ошибок синтеза белка, которые иногда случаются в нашем организме, с гена SMN2 может синтезироваться небольшое количество правильного, функционального белка, необходимого для работы двигательных нейронов. Именно поэтому даже при полном отсутствии нормального белка с гена SMN1 количество копий гена SMN2 влияет на тяжесть симптомов.

Информация о количестве копий генов SMN1 и SMN2 позволяет диагностировать заболевание и оценить риск рождения в семье ребенка с диагнозом СМА. Если оба родителя являются носителями мутации в гене SMN1, вероятность рождения ребенка с СМА равна 25%. Однако обычными методами невозможно уточнить количество копий генов SMN1 и SMN2.

Правильная молекулярная диагностика носительства СМА и самого заболевания осложнена схожестью генов SMN1 и SMN2. Для диагностики необходимо использовать методы, позволяющие различить эти гены по немногим отличающимся точкам. Так как ключевую роль играет именно экзон 7, необходимо использовать метод, который позволяет определить количество его копий в гене SMN1.

Сегодня единственным методом точного определения количества копий каждого гена является анализ методом MLPA (мультиплексная амплификация лигазно- связанных проб). В результате анализа лаборатория получает заключение о количестве 7 и 8 экзонов генов SMN1 и SMN2. Все остальные методы позволяют выявить наличие/отсутствие указанных экзонов генов, но не определить количество копий каждого. Хотя у большинства пациентов со СМА выявляются делеции 7 и 8 экзона в гене SMN1, для молекулярного подтверждения диагноза ориентируются только на данные по количеству копий 7 экзона.

Методов эффективного лечения СМА не существует. В настоящее время 2 фармакологические компании разработали генно-терапевтические препараты для лечения СМА. Препарат SPINRAZA (Biogen) разрешен к использованию в ЕС, однако стоимость такого лечения очень высока. Препарат AVXS-101 (AveXis) находится на стадии клинических испытаний и когда он будет доступен для лечения детей со СМА неизвестно. Сейчас доступна только поддерживающая терапия, в зависимости от тяжести заболевания.

Поэтому так важно иметь возможность снизить риск рождения больного ребенка в семье. Для этого необходимо проводить генотипирование будущих родителей, которое позволит оценить риск для потомства. В случае выявления статуса носительства мутаций в гене SMN1 обоими родителями, им может быть рекомендована пренатальная или преимплантационная генетическая диагностика СМА.

Источник

Что такое делеция, структурные хромосомные мутации?

Статья опубликована: 2018-12-25

Рейтинг: 5 из 5

Геном человека устроен таким образом, что для нормальной жизни у нас должно быть ровно 23 пары хромосом. Хромосомы существуют именно парно, потому что одна хромосома в паре приходит от мамы, а другая от папы. Нарушение в числе хромосом приводит к тяжелым заболеваниям, например, синдрому Дауна. Однако, количество хромосом может быть в норме, но все равно человек имеет аномалии в развитии, которые не совместимы с нормальной и долгой жизнью.

Дело в том, что могут быть отклонение в самой структуре хромосомы. Из хромосомы выпадают участки. Такое явление называется делецией. Делеция происходит от лат. deletio что значит уничтожение. Такая аномалия может возникать в результате неравного кроссинговера или при разрыве хромосомы.

Признаки делеционного синдрома

Делеции или микроделеции могут вообще внешне не проявляться. Человек может всю жизнь прожить с этим синдромом и не знать о его существовании. Заболевание может обнаружится, например, когда возникнет необходимость завести ребенка, но попытки будут безуспешными.

Существуют делеции с явно выраженными внешними признаками:

• Синдром Ди Джорджи. Ребенок с этим синдромом может иметь отклонения в лицевой области: расщепление неба, “заячья губа”, деформированные ушные раковины, маленький рот, широкую переносицу. Также часты пороки сердца, мочеполовой системы, умственные отклонения.
• Синдром делеции 1p36. К внешним лицевым признакам относятся: маленький рот, близко посаженные глаза, заостренный подбородок, маленькие уши, плоский нос, поздно закрывающийся родничок. Также наблюдается наличие аутизма и задержек в умственном развитии. Пороки сердечно-сосудистой системы. Нарушение развития речи и слуха.
• Синдром «кошачьего крика». Внешне проявляется так: микроцефалия, аномальный разрез глаз, недоразвитые хрящи ушных раковин, недоразвитие нижней челюсти. Характерным признаком является деформация гортани при которой плач ребенка похож на мяуканье голодного котенка (более высокие тона, чем у обычного плача).

Причины появления делециий

Существует несколько причин, при которых возможно развитие делеционного синдрома:

• Наследственные хромосомные аномалии, полученные от родителей;
• Возраст матери более 40 лет и отца болен 45 лет;
• Перенесение тяжелых заболеваний на ранних сроках беременности и при зачатии;
• Плохой анамнез и т.д.

Диагностика синдромов

Выявить наличие делеций возможно на ранних сроках беременности. Уже на 9-ой недели по венозной крови матери можно провести ДНК анализ и диагностировать заболевание. Такое генетическое исследование называется неинвазивный пренатальный ДНК тест. Тест проводится без направления врача, т. к. не имеет противопоказаний и побочных эффектов.

Генетический центр “ДТЛ” выполняет НИПТ тесты уже более 4 лет. В сотрудничестве с ведущими мировыми лабораториями в области пренатальной диагностики нами проведено уже болен 1000 подобных исследований.

Источник